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这5个方面相互协调，产生激素，完成男性性别发育及维持男性活动，同时男性生殖内分泌轴也参与精子成熟的调控，维持正常的生殖功能。与男性生殖功能有关的激素主要有下丘脑分泌的促性腺激素释放激素，垂体前叶分泌的促卵泡刺激素，促黄体生成素，催乳素，以及睾丸自身分泌的睾酮和双氢睾酮。如果某一部分功能紊乱导致任一激素含量异常，均可影响男性生育能力。不仅如此，其他内分泌腺功能紊乱，也影响精子的发生及性功能。肾上腺和甲状腺疾病可造成睾丸生精障碍;糖尿病可造成阴茎勃起功能障碍，逆射精和精子生成障碍;下丘脑—垂体—睾丸生殖内分泌轴功能障碍可直接造成男性不育。不育男性中有约10%存在内分泌功能障碍。
内分泌异常是导致男性不育的重要原因之一，必须加以重视，男性不育跟以下几方面有关系：
1、甲状腺功能减退症：常见于呆小病病等。
2、甲状腺功能亢进症：常见于突限性甲状腺肿等。
3、糖尿病：I型糖尿病患者，生精上皮发生退行性变，精子数减少，死精子增多，并可有明显阳萎。Ⅱ型糖尿病症状较轻，对生育影响较小，且Ⅱ型糖尿病发生于年龄较大的人，因而与生育的关系并不密切。
4、柯兴氏综合证：系肾上腺皮质激素分泌过多所致，多见于肾上腺肿瘤。患者有性欲减退、阳萎，血浆睾酮水平低下，睾丸组织萎缩，间质细胞退化，精子生成障碍。
5、垂体病变：垂体的功能亢进，可能会导致早期性欲增加、体型改变等表现，继而会发生性欲减退、精液异常而导致不育。垂体功能低下，也会引起性欲和性交能力降低，睾丸萎缩，以导致睾丸内分泌功能不足，精子减少，甚至死精子，而导致不育。
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